【結論は…】

「暗雲が垂れ込める」が本来の言い方であり、意味的にも「暗雲が垂れ込める」が正しい。

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次の記事に続く 「腑に落ちる」と「腑に落ちない」…実はどちらかが間違い!? よく使われているのは…《その道37年の辞書編集者に聞いてみた》